Die Silbe HA steht für die helle, aktive, männliche Energie der Sonne und THA für die dunkle, passive Energie des Mondes. Sonne und Mond stehen symbolisch für die Götter Shiva und seine Partnerin Shakti. Die Vereinigung der beiden gilt im Hinduismus als Symbol für vollendete kosmische Energie.
HATHA sind also Methaphern für die beiden sich ergänzenden Energieströme im menschlichen Körper, die es mit Hilfe des HATHA-Yoga zu vereinigen, und zu harmonisieren gilt.